培養(yǎng)箱內(nèi)相對(duì)濕度的控制是非常重要的，維持足夠的濕度水平才能保證不會(huì)由于過(guò)度干燥而導(dǎo)致培養(yǎng)失敗。大型的二氧化碳培養(yǎng)箱是用蒸汽發(fā)生器或噴霧器來(lái)控制相對(duì)濕度水平的，而大多數(shù)中、小型培養(yǎng)箱則是通過(guò)濕度控制面板（humidity pans）的蒸發(fā)作用產(chǎn)生濕氣的（其產(chǎn)生的相對(duì)濕度水平可達(dá)95-98％）。一些培養(yǎng)箱有一個(gè)能在加熱的控制面板上保持水份的濕度蓄水池（humidity reservoir），這樣可以增強(qiáng)蒸發(fā)作用，此蓄水池能增加相對(duì)濕度水平達(dá)97-98％。但是，這個(gè)系統(tǒng)也更復(fù)雜，由于復(fù)雜結(jié)構(gòu)的增加一些難以預(yù)料的問題也會(huì)在使用過(guò)程中出現(xiàn)。

每一個(gè)使用者都希望所用的儀器能夠方便好用，微處理控制系統(tǒng)和其它各種功能附件（如高溫自動(dòng)調(diào)節(jié)和警報(bào)裝置、CO2警報(bào)裝置、密碼保護(hù)設(shè)置、自動(dòng)校準(zhǔn)系統(tǒng)等等）的運(yùn)用，就使得二氧化碳培養(yǎng)箱的操作和控制都非常的簡(jiǎn)便。微處理控制系統(tǒng)是維持培養(yǎng)箱內(nèi)溫度、濕度和CO2 濃度穩(wěn)態(tài)的操作系統(tǒng)。